Özbekistan'daki en büyük yükseköğretim kurumlarından ve araştırma merkezlerinden biridir. 1918'de Taşkent'te Türkistan Müslüman Halk Üniversitesi adıyla açıldı. Kuruluşundan beri çeşitli adlar aldı: Türkistan Devlet Üniversitesi (1920), Orta Asya Devlet Üniversitesi-SAGU (1923), Taşkent Devlet Üniversitesi (1960), Mirzo Uluğbek Üniversitesi ve nihayet Ocak 2000'de üniversiteye millî üniversite statüsü verilmiş ve bugünkü Özbekistan Millî Üniversitesi adını almıştır.
Türkistan Müslüman Halk Üniversitesi, bölgede ulusal kadrolar yetiştiren ilk yükseköğretim kurumuydu. Bu okulun kurucuları Ceditçiler'di ve başlangıçta Türkistan'ın yerel etnik grupları değil Rusları eğitecek yüksek, orta ve lise düzeyinde meslekî eğitim verecek bir kurum olarak planlanmıştır.
Aynı yıl üniversite bünyesinde Türkistan Halk Kütüphanesi, Türkistan Halk Müzesi, konservatuar ve Şarkiyat Enstitüsü kuruldu. Üniversite Aralık 1919 tarihinde Türkistan Devlet Üniversitesi (TDU) statüsünü aldı. II. Dünya Savaşı yıllarında Sovyetler Birliği'nin merkez şehirlerden çok sayıda bilim adamı ve eğitim kurumu Özbekistan'a gönderildi. Üniversite profesörlerinin sayısı daha da güçlendirildi. Üniversitedeki öğretim ve araştırma faaliyetleri, savaş yıllarının ihtiyaçlarını karşılamak üzere yeniden düzenlendi. Beş yıllık eğitim sistemi üç yıla indirilmiş, müfredat da buna uygun olarak yeniden yapılandırılmıştır. 1961-1969 yıllarında Taşkent Devlet Üniversitesi, modern yapısı ve eğitim sistemi ile bölge üniversiteleri arasında en prestijli yükseköğretim kurumlarından biri haline gelmiştir. 1990'ların başında Taşkent Üniversitesi'nde 19.000 öğrenci eğitim alıyordu.
Günümüzde Özbekistan Millî Üniversitesi öğretim sürecinin ve araştırma alanlarının geliştirilmesi için gerekli olan fakültelere, modern tesislere, uluslararası kabul görmüş bilimsel ekollere sahiptir. Güncel olarak on yedi fakülte (Matematik, Uygulamalı Matematik ve Entelektüel Teknoloji, Fizik, Biyoloji, Ekoloji, Kimya, Yabancı Diller, Ekonomi, Sosyal Bilimler, Gazetecilik, Tarih, Coğrafya ve Coğrafi Bilgi Sistemleri, Jeoloji ve Jeoloji Mühendisliği, Hidrometeoroloji, Tekvando ve Spor Etkinlikleri, Özbek Filolojisi, Özbekistan-İsrail Ortak Fakültesi) ve 1295 akademik personeliyle birlikte 33.930 öğrenciye (31.440 lisans, 2.490 lisansüstü) eğitim hizmeti vermektedir. Özbekistan Millî Üniversitesi, diğer ülkelerin 100'den fazla yüksek eğitim ve bilim kurumu ile akademik iş birliği yapmaktadır.