Genesis Therapeutics

Genesis Therapeutics, Kaliforniya’nın Burlingame kentinde merkezi bulunan ve San Diego’da tam entegre bir laboratuvarla faaliyet gösteren bir biyoteknoloji ve yapay zekâ (YZ) şirketidir. Şirket, ileri düzey generatif ve kestirimsel yapay zekâ modelleriyle biyoteknolojiyi birleştirerek, ciddi ve tedaviye dirençli hastalıklar için yeni küçük moleküllü tedavilerin keşfine odaklanmaktadır. Genesis, bu doğrultuda geliştirdiği GEMS (Genesis Exploration of Molecular Space) adlı tescilli YZ platformuyla ilaç keşif süreçlerini hızlandırmakta ve optimize etmektedir.

GEMS, derin öğrenme tabanlı kestirimsel modeller, moleküler simülasyonlar ve generatif YZ tekniklerini bir araya getiren çok katmanlı bir platformdur. Bu sistem, ilaç adaylarının tasarımından seçimine kadar olan süreçte moleküler yapıların üretimini ve test edilmesini yinelemeli biçimde gerçekleştirir. GEMS’in bileşenleri arasında dil modelleriyle molekül üretimi, difüzyon modelleriyle protein-ligand yapı tahmini ve fizik tabanlı makine öğrenimiyle etki gücü ve seçicilik kestirimi yer almaktadır. Bu yaklaşım, “undruggable” olarak tanımlanan hedeflere yönelik ilaç tasarımında yeni bir kapı açmaktadır.

Araştırma ve Teknoloji Alanları

Genesis’in araştırma çalışmaları, makine öğrenimi, fizik ve kimya kesişiminde yürütülmektedir. Şirketin araştırma ekibi, moleküllerin “dilini” anlayabilen yeni nesil temel modeller geliştirmektedir.

Başlıca araştırma alanları şunlardır:

• Generatif Difüzyon Modelleri: Üç boyutlu moleküler yapıların yüksek hassasiyetle üretilmesini sağlayan akış eşleme ve difüzyon tabanlı teknikler.
• Bilim Odaklı Büyük Dil Modelleri (LLM): Moleküler yapılar ve kimyasal tepkimeleri kavrayarak yeni moleküller türetebilen özel LLM’ler.
• Takviye Öğrenimi: Çok hedefli optimizasyon problemlerinin çözümüne yönelik yönlendirilmiş molekül üretimi.
• Çok Modlu Öğrenme: Farklı veri türlerini (3B yapılar, biyolojik test sonuçları vb.) bütünleştirerek farmakokinetik ve toksisite özelliklerini öngörme.
• Geometrik ve 3B Derin Öğrenme: Moleküler sistemlerin fiziksel simetrilerini dikkate alan ekvivalent ağların geliştirilmesi.

Genesis Therapeutics, GEMS platformunu kullanarak onkoloji ve immünoloji alanlarında çeşitli ilaç geliştirme programları yürütmektedir. Şirketin iç portföyü, veri açısından yetersiz veya klasik yöntemlerle hedeflenemeyen biyolojik hedeflere karşı geliştirilen ilaç adaylarını içermektedir. 2020 yılında Genentech, 2022’de Eli Lilly ile başlayan iş birliklerine ek olarak 2024’te Gilead ve 2025’te Incyte ile çok hedefli ortaklık anlaşmaları yapılmıştır. Bu anlaşmalar, toplamda 65 milyon ABD doları tutarında peşin ödemeleri kapsamaktadır.

Finansman ve Yatırımcılar

Genesis, Andreessen Horowitz, T. Rowe Price, Rock Springs Capital, Fidelity, BlackRock, Radical Ventures, Menlo Ventures ve NVIDIA’nın yatırım kolu NVentures gibi önde gelen teknoloji ve biyoteknoloji yatırımcılarından 300 milyon ABD dolarını aşan finansman sağlamıştır. 2024’te NVIDIA ile yapılan yatırım ve iş birliği, hesaplamalı yöntemler ve ekvivalent sinir ağı mimarilerinin geliştirilmesini hızlandırmıştır.

Patentler ve Bilimsel Katkılar

Genesis, yapay zekâ tabanlı ilaç keşfi alanında üç temel patente sahiptir:

• Molekül üretimi için hesaplamalı platform (US12159693B2)
• Kimyasal hesaplama grafikleri (US12230367B2)
• Moleküllere ilişkin metinsel sorgulara dayalı generatif makine öğrenimi (US12288600B2)

Ayrıca şirket araştırmacıları ICML, Stanford AI+Biomedicine Semineri ve MIT Tech Talk gibi etkinliklerde küçük molekül keşfi, generatif modelleme ve biyomedikal yapay zekâ üzerine bilimsel sunumlar yapmıştır.

Yapı ve Organizasyon

Şirketin merkezi Burlingame, Kaliforniya’da; entegre ıslak laboratuvarı San Diego’da; teknik merkezi ise New York City’dedir. Çalışanlarının bir bölümü uzaktan çalışmaktadır. CEO ve kurucu ortak Evan Feinberg, COO Will McCarthy ve CSO Shifeng Pan tarafından yönetilen liderlik ekibinde, OpenAI, DeepMind, Meta ve Google gibi kuruluşlardan gelen uzmanlar yer almaktadır.