Deep Genomics, yapay zekâ destekli genetik tedavi geliştirme alanında faaliyet gösteren bir biyoteknoloji şirketidir. Merkezi Toronto, Ontario, Kanada’da bulunan şirketin ayrıca Boston, Massachusetts’te bir ofisi vardır. Deep Genomics, biyolojik sistemlerin karmaşıklığı nedeniyle tıbbi ilerlemenin geleceğinin yapay zekâ ile mümkün olacağı anlayışıyla çalışmaktadır. Şirket, genetik bozuklukların tespiti ve tedavisine yönelik olarak yapay zekâ tabanlı biyolojik modeller geliştirmektedir.

Bilimsel Yaklaşım ve Araştırma Alanları

Deep Genomics, RNA biyolojisini yapay zekâ destekli bir platform aracılığıyla analiz ederek genetik hastalıkların kökeninde yer alan mekanizmaları çözümlemeyi amaçlamaktadır. Çalışmalar, RNA’yı terapötik bir araç olarak programlamayı ve genetik temelli hastalıkların tedavisine yönelik hedeflerin belirlenmesini kapsamaktadır. Geliştirilen sistemler, RNA biyolojisi verilerini analiz ederek olası genetik varyantları değerlendirir ve en uygun tedavi adaylarını tanımlar.

Yapay Zekâ Platformu ve BigRNA Modeli

Deep Genomics’in temel teknolojik altyapısı, geniş veri kümeleri, veri işleme hatları, makine öğrenimi sistemleri (temel modeller ve büyük dil modelleri dâhil) ve yazılım mühendisliği bileşenlerinden oluşan özel bir yapay zekâ platformudur. Bu platform, biyolojik doğruluk hedefiyle geliştirilmiş olup genetik düzeydeki etkileşimleri yüksek çözünürlükte modelleyebilmektedir.

2018 yılında platform, RNA eksonlama hatalarını tanımlayarak bu hataları düzeltmeye yönelik ilk terapötik hedefleri ortaya koymuştur. 2023 yılında RNA biyolojisi için ilk temel model olan BigRNA yayımlanmıştır. Bu model, RNA ekspresyonunu gen altı çözünürlükte öngörebilen bir yapay zekâ sistemidir. BigRNA, genetik hedeflerin tanımlanması, molekül-hedef etkileşimlerinin öngörülmesi, terapötik adayların tasarımı ve in vivo testler için vekil moleküllerin geliştirilmesi gibi çok sayıda işlevi gerçekleştirebilmektedir. BigRNA’nın halefi BigRNA+, daha karmaşık genetik hastalıklar için yeni biyolojik mekanizmaların ve genetik varyantların araştırılmasına olanak sağlamayı hedeflemektedir.

Bilimsel Yayınlar ve Katkılar

Deep Genomics araştırmacıları, RNA biyolojisi, genetik varyant analizi ve derin öğrenme uygulamaları alanlarında çok sayıda bilimsel yayın üretmiştir. Bu yayınlar arasında Nature Biotechnology, Science, NPJ Genomic Medicine, Frontiers in Molecular Biosciences ve Nucleic Acid Therapeutics gibi dergilerde yayımlanan çalışmalar yer almaktadır. 2015 yılında yayımlanan “The Human Splicing Code Reveals New Insights into the Genetic Determinants of Disease” başlıklı çalışma, gen düzenlemesi ve hastalık ilişkisi konusundaki ilk kapsamlı derin öğrenme uygulamalarından biri olarak öne çıkmıştır.

Yönetim Kadrosu ve Uzmanlık Alanları

Şirketin yönetim ekibinde kurucu ve Baş Yenilik Sorumlusu Brendan Frey, Üst Düzey Yönetici Brian O’Callaghan, Bilim Direktörü Greg Hoffman ve diğer alan uzmanları bulunmaktadır. Deep Genomics bünyesinde 100’ü aşkın çalışan yer almakta olup ekip; yapay zekâ, moleküler biyoloji, organik kimya, klinik geliştirme, in vitro hastalık modelleme, otomasyon ve yazılım mühendisliği gibi disiplinlerde uzmanlaşmıştır.

Danışmanlar arasında Yann LeCun, Masad Damha, Jennifer Cook ve Benjamin Neale gibi uluslararası bilim ve endüstri alanlarında tanınmış isimler bulunmaktadır.

Konum ve Araştırma Ekosistemi

Deep Genomics’in Toronto’daki merkez ofisi, MaRS Discovery District’te yer almakta olup University of Toronto, araştırma hastaneleri ve Vector Institute for Artificial Intelligence gibi kuruluşlarla çevrilidir. Bu konum, şirketin hem akademik hem de endüstriyel araştırma iş birlikleri için stratejik bir avantaj sağlamaktadır.

Finansal ve Kurumsal Yapı

Şirketin yatırımcıları arasında SBIA, Fidelity, CPP Investments, Khosla Ventures ve True Ventures gibi küresel yatırım fonları yer almaktadır. Yönetim kurulu, akademi ve endüstri kökenli üyelerden oluşmaktadır.

Bilimsel Hedef ve Vizyon

Deep Genomics, genetik temelli hastalıkların tedavisinde RNA terapilerini kullanarak “her gen ve her genetik durum” için uygulanabilir çözümler üretmeyi hedeflemektedir. Şirket, yapay zekâ destekli platformlarının ölçeklenebilirliği sayesinde, yeni hedeflerin tanımlanması ve tedavi adaylarının geliştirilmesi süreçlerini hızlandırmaktadır.